Ich hatte mit MIOSStudio Beta7 ähnliche Probleme beim Upload von Anwendungen. Der Smart Mode hat einfach nicht funktioniert bzw hat die Daten zu schnell geschickt. Probier mal den Manual Mode mit einem großen Delay, bei mir hat es ab ca. 950ms funktioniert. Dauert zwar dann ein wenig, aber zumindest kann man was uploaden. Mit MIOSStudio Beta8 geht bei mir auch der Smart Mode ohne Probleme.